细胞实验室根据功能分区可以分为洁净区和非洁净区。洁净区包含：更衣区；缓冲区；细胞制备区；细胞培养区；配液区；微生物检测区。非洁净区包含：样本接收区；免疫检测区；细胞生物学检测区；理化检测区；物料存放区；清洗消毒区；气体储存区；信息中心区；细胞储存区；档案存放区。

在建设的过程中总建筑面积宜不小于1000m2。洁净区使用面积宜不小于500m2。

洁净室的净高度应在2.5-2.8m之间。总体布局不应交叉混合使用，且应符合人、物分流的原则。人流通道、洁净区入口应设缓冲室。废物、污染物应设置专用传递窗，不应与细胞产品、洁净物品合用一个传递窗。传递窗送风方式应采用上送侧回的方式。通道门的开启方向应由低洁净级向高洁净级的方向开启。所有洁净区不应安装水池和地漏。

洁净区的环境技术指标应符合以下要求：更衣、缓冲、细胞制备区、细胞培养区的空气洁净度应满足C级。温度应控制在22±4℃，湿度应控制在45%～65%为宜；

在通风方面洁净区与非洁净区之间、不同空气洁净度的洁净区之间的压差应＞10Pa。洁净区内不同功能及级别房间之间宜保持适当的压差梯度，以防止污染和交叉污染；总送风量中（非单向流）应有10%～30%的新风量；